Prema naputku Nacionalne i sveučilišne knjižnice u Zagrebu karantena, za knjižničnu građu i poštanske pošiljke, postoji i u Knjižnici FOI-ja. Sve vraćene knjige, sva pristigla pošta i paketi odlažu se u karantenu u izdvojenom dijelu knjižnice te se slažu po datumima pristizanja. Nakon isteka 72 sata karantene knjižnična građa se posuđuje drugim korisnicima ili se vraća na police, a pošiljke se otvaraju i obrađuju. Korisnici tako s povjerenjem i nadalje mogu rezervirati i posuđivati knjižničnu građu.