Sustav osiguravanja kvalitete FOI-ja formalno je uspostavljen 2010. godine. Temeljni dokument internog sustava osiguravanja kvalitete FOI-ja je Pravilnik o sustavu osiguravanja kvalitete. Pravilnikom su uređeni cilj, svrha, područja vrjednovanja te ustroj i djelovanje sustava osiguravanja
kvalitete na FOI-ju, uloga Fakultetskog vijeća FOI-ja u sustavu osiguravanja kvalitete, ustroj i djelovanje Povjerenstva za osiguravanje kvalitete FOI-ja, ustroj i djelovanje Ureda za osiguravanje kvalitete FOI-ja, kao i područja unutar kojih se provode mjere i aktivnosti osiguravanja kvalitete na FOI-ju.
Područja osiguravanja i unaprjeđivanja kvalitete koje je FOI među prvima uskladio sa Standardima i smjernicama za osiguravanje kvalitete na europskom prostoru visokog obrazovanja, jesu:
- pravila i postupci razvoja, osiguravanja i unaprjeđivanja sustava kvalitete na FOI-ju;
- izrada, odobravanje, nadzor i periodično vrjednovanje studijskih programa koji se izvode na FOI-ju;
- poučavanje studenata, vrjednovanje studentskog rada i ocjenjivanje; resursi za učenje i potpora studentima od upisa do završetka studija;
- kompetencije nastavnika; znanstveno-istraživačka djelatnost; stručna djelatnost; mobilnost i međunarodna suradnja, resursi za obrazovnu, znanstveno-istraživačku i stručnu djelatnost;
- informacijski sustav ustanove te javnost djelovanja.
Sva navedena područja obuhvaćena su godišnjim planovima aktivnosti za osiguravanje kvalitete i izvješćima o osiguravanju kvalitete.